Пластырь

Новости

ДомДом / Новости / Пластырь

May 26, 2023

Пластырь

Журнал вирусологии, том 20, номер статьи: 142 (2023) Цитировать эту статью 524 Доступ 3 Подробности об альтернативных метриках SARS-CoV-2 вызвал всемирную пандемию с декабря 2019 года и поиск

Журнал вирусологии, том 20, Номер статьи: 142 (2023) Цитировать эту статью

524 доступа

3 Альтметрика

Подробности о метриках

SARS-CoV-2 вызвал мировую пандемию с декабря 2019 года, и поиск фармацевтических средств против COVID-19 остается важной задачей. Здесь мы изучили оболочечный белок E SARS-CoV и SARS-CoV-2, высококонсервативный виропорин, состоящий из 75–76 аминокислот, который имеет решающее значение для сборки и высвобождения вируса. Белковые каналы Е были рекомбинантно экспрессированы в клетках HEK293, мембрано-направленный сигнальный пептид обеспечивал перенос на плазматическую мембрану.

Активность виропориновых каналов обоих белков Е исследовали с использованием электрофизиологии патч-кламп в сочетании с анализом жизнеспособности клеток. Мы подтвердили ингибирование классическими ингибиторами виропорина амантадином, римантадином и 5-(N,N-гексаметилен)амилоридом и протестировали четыре производных ивермектина.

Классические ингибиторы показали высокую активность в патч-кламп-записях и анализах жизнеспособности. Напротив, ивермектин и милбемицин ингибировали Е-канал в патч-кламп-записях, но проявляли лишь умеренную активность в отношении белка Е в анализе жизнеспособности клеток, который также чувствителен к общей цитотоксической активности тестируемых соединений. Немадектин и агликон ивермектина были неактивны. Все производные ивермектина были цитотоксичными в концентрациях > 5 мкМ, т.е. ниже уровня, необходимого для ингибирования белка Е.

Это исследование демонстрирует прямое ингибирование белка E SARS-CoV-2 классическими ингибиторами виропорина. Ивермектин и милбемицин ингибируют канал белка Е, но их цитотоксичность препятствует клиническому применению.

Коронавирусы стали причиной крупных вспышек респираторных заболеваний SARS, MERS и эпидемии COVID-19 в 2019 году, вызванной SARS-CoV-2 [1]. Тяжелая инфекция SARS-CoV-2 приводит к серьезному нарушению функции легких, часто связанному с системным воспалением и массивным выбросом воспалительных цитокинов, известному как цитокиновый шторм [2,3,4], который также известен при других вирусных заболеваниях. [5,6,7]. Всемирная кампания вакцинации была необходима для снижения распространения COVID-19, однако появились новые штаммы SARS-CoV-2, и существует постоянный риск появления новых штаммов, частично [8] или даже полностью устойчивых. к нынешним вакцинам. Помимо профилактики заражения посредством вакцинации, эффективное лечение инфицированных пациентов является важной необходимостью в борьбе с SARS-CoV-2.

SARS-CoV-2 представляет собой оболочечный одноцепочечный вирус с положительной смысловой РНК, содержащий в своем геноме 14 открытых рамок считывания. Они кодируют структурные белки, образующие капсид вируса, включая белок-шип (S), мембранный белок (М), белок оболочки (Е) и белок нуклеокапсида (N), а также неструктурные белки, в том числе белки вирусный репликазный и протеазный аппарат, а также вспомогательные белки [3].

Белок оболочки E и белок ORF3a SARS-CoV-2 относятся к классу виропоринов, группе в основном небольших гидрофобных интегральных мембранных белков, которые собираются в мембранные каналы, обычно расположенные во внутриклеточных мембранах ЭР и аппарата Гольджи [9]. ,10,11]. Поскольку виропорины необходимы для репликации и высвобождения вируса, они действительно являются жизнеспособными мишенями для противовирусных препаратов [9, 10, 12, 13]. Первым хорошо охарактеризованным виропорином был канал М2 вируса гриппа А [14,15,16]. Другими виропоринами являются канал р7 гепатита С [17, 18] и вирусный белок U вируса иммунодефицита человека [19]. Виропорины участвуют в цикле вирусной инфекции двумя способами: (i) вызывают ионный дисбаланс и нарушают градиенты pH за счет своего действия в качестве внутриклеточных ионных каналов и (ii) разрушают клеточные пути посредством белок-белковых взаимодействий [2, 9, 12, 20].

Белки Е обнаружены у всех коронавирусов, и, несмотря на различия в размере белка (75–109 аминокислот) и последовательности [21], их структура высококонсервативна, включая короткий N-концевой сегмент, длинный альфа-спиральный участок, вероятно, включающий один трансмембранный участок. домен и неструктурированный карбокси-конец [9]. Последовательность белка E высококонсервативна между SARS-CoV (1-E) и SARS-CoV-2 (2-E), которые отличаются одной делецией и тремя замененными остатками, все из которых расположены вблизи С-концевого конца. Белок из 76 аминокислот.

 0.05 (one-way ANOVA)/p> 10 µM, as had been reported before [29, 41]. Electrophysiological measurements on 2-E expressing HEK293 cells (Fig. 3C) revealed the same pattern of activity for all classical inhibitors with HMA being the most active, next rimantadine, and amantadine being the least active (Rim IC50 = 3.6 ± 0.6 nM, Ama IC50 = 24.1 ± 6.5 nM, HMA IC50 = 1.9 ± 0.3 nM, Fig. 3 D, E). It is noted that patch-clamp electrophysiology was performed directly on the cells where the E protein was present in the outer plasma membrane due to the membrane-directing signal sequence. This experimental configuration allows a direct interaction of the E protein channel and the inhibitor. IC50 values of the inhibitors established from patch-clamp experiments are thus much smaller than those obtained from cellular assays where the inhibitor first has to enter cells before binding to its target. When comparing patch-clamp inhibition data of 2-E to those of 1-E, we observed the same pattern of inhibitory potency (HMA > rimantadine > amantadine) for both channels, while there is a small difference in the extent of inhibition, with reduced activity for 2-E compared to 1-E (factor of ~ 2)./p>